Edita el fichero /etc/rc.local
Coloca los comandos o scripts que quieres que se ejecuten al iniciar el sistema
Asegúrate que la última línea de este fichero sea exit 0
Ejecutar scripts al apagar Ubuntu
Vete a la carpeta /etc/rc6.d
Coloca bajo esa carpeta tu script
Asígnale permiso de ejecución con sudo chmod +x <tuscript>
Cámbiale el nombre por KxxTuScript donde xx es el orden de ejecución (K01tuscript se ejecutará en primer lugar en la secuencia de cierre)