He estado mucho tiempo utilizando Hotshots como herramienta para capturar la pantalla o trozos de la pantalla y luego editar la captura para resaltar algún área o algún aspecto de la captura.
En este link tienes explicado cómo instalar y cómo usar Hotshots en Linux:
http://fpkanarias.blogspot.com.es/2015/07/hotshots-posiblemente-la-mejor.html
La realidad es que este software excelente ya no se puede instalar en las últimas versiones de Ubuntu, así que he tenido que buscar un sustituto, y todos los caminos apuntan a Shutter.
Veamos cómo instalarlo en Ubuntu Linux 15.10 y su funcionamiento básico.
Desde consola
sudo add-apt-repository -y ppa:shutter/ppa
sudo apt-get update
sudo apt-get install shutter
Termina la instalación de shutter
Abrimos shutter. Para ello, simplemente: shutter
Mientras carga nos muestra una pantalla como ésta
Pantalla principal de shutter
Opciones de shutter
Marcamos la opción de "Iniciar Shutter al iniciar sesión"
Esta pantalla ha sido capturada y edita ya con Shutter
Fíjate como en la barra superior de mi sistema ya aparece el icono de Shutter